Dos años después de que el Comandante Shepard ahuyentara a los Segadores empeñados en destruir la vida orgánica, un nuevo y misterioso enemigo ha surgido en Mass Effect 2. En los límites del espacio conocido, algo está abduciendo en silencio a todas las colonias de humanos.
Así que ahora Shepard debe trabajar con Cerberus, una implacable organización dedicada a la supervivencia humana a toda costa, para detener a la amenaza más terrible a la que jamás se ha enfrentado la humanidad.
Para hacer frente a esta peligrosa misión, Shepard tendría que reunir al mejor equipo de especialistas de élite de la galaxia y dirigir la nave más potente jamás construida. Incluso en ese caso, dicen que sería un suicidio.
El Comandante Shepard quiere demostrar que se equivocan.